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小干扰RNA（siRNA），有时称为短干扰RNA或沉默RNA，是一类双链RNA分子，长度为20-25个碱基对，类似于miRNA，并且在RNA干扰（RNAi）途径内操作。它干扰了表达与互补的核苷酸序列的特定基因的转录后降解的mRNA，从而防止翻译。

含有茎环结构的miRNA前体，经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子（18~25个核苷酸）。MiRNA，以及miRISCs（RNA诱导基因沉默复合物）在动物和植物中广泛表达。因之具有抑制靶mRNA转录、翻译或者能够剪切靶mRNA并促进其降解的功能，miRNA被认为在调控发育过程中有重要作用。

sgRNA（small guide RNA）是向导RNA（guide RNA，gRNA），在RNA编辑的过程中引导尿苷残基插入或缺失到动质体中，属于一种小型非编码RNA，可与pre-mRNA配对。gRNA编辑RNA分子，长度大约60-80个核苷酸，由单独的基因转录。